Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TXNDC2Q86VQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TXNDC2Q86VQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TXNDC2Q86VQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TXNDC2Q86VQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TXNDC2Q86VQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TXNDC2Q86VQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TXNDC2Q86VQ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TXNDC2Q86VQ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TXNDC2Q86VQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms