Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRTM1Q86UE6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM1Q86UE6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRTM1Q86UE6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms