Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF550Q7Z398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF550Q7Z398 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF550Q7Z398 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF550Q7Z398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.7 ms