Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC11Q7Z392 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC11Q7Z392 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC11Q7Z392 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC11Q7Z392 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC11Q7Z392 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms