Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX8Q7RTT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSX8Q7RTT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX8Q7RTT4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX8Q7RTT4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms