Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT13Q7L8C5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT13Q7L8C5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT13Q7L8C5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT13Q7L8C5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYT13Q7L8C5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYT13Q7L8C5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT13Q7L8C5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT13Q7L8C5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYT13Q7L8C5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms