Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIAA1549LQ6ZVL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIAA1549LQ6ZVL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIAA1549LQ6ZVL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIAA1549LQ6ZVL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIAA1549LQ6ZVL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms