Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM43BQ6ZT52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM43BQ6ZT52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM43BQ6ZT52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM43BQ6ZT52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM43BQ6ZT52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms