Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC73Q6ZRK6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC73Q6ZRK6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC73Q6ZRK6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC73Q6ZRK6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms