Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RUFY4Q6ZNE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY4Q6ZNE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY4Q6ZNE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY4Q6ZNE9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms