Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM20Q6UY09 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM20Q6UY09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM20Q6UY09 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM20Q6UY09 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms