Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HRCT1Q6UXD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HRCT1Q6UXD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HRCT1Q6UXD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HRCT1Q6UXD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms