Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATRAIDQ6UW56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATRAIDQ6UW56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRAIDQ6UW56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRAIDQ6UW56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms