Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBLN3Q6UW01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLN3Q6UW01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLN3Q6UW01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms