Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RWDD4Q6NW29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RWDD4Q6NW29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RWDD4Q6NW29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RWDD4Q6NW29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RWDD4Q6NW29 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms