Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD276Q5ZPR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD276Q5ZPR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD276Q5ZPR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD276Q5ZPR3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms