Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHEQ5VZ18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHEQ5VZ18 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHEQ5VZ18 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHEQ5VZ18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms