Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
C9orf84Q5VXU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
C9orf84Q5VXU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
C9orf84Q5VXU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
C9orf84Q5VXU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
C9orf84Q5VXU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
C9orf84Q5VXU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
C9orf84Q5VXU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms