Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CEP350Q5VT06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP350Q5VT06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CEP350Q5VT06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CEP350Q5VT06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP350Q5VT06 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CEP350Q5VT06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CEP350Q5VT06 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CEP350Q5VT06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CEP350Q5VT06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CEP350Q5VT06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CEP350Q5VT06 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CEP350Q5VT06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CEP350Q5VT06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms