Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIF1Q5UIP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIF1Q5UIP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIF1Q5UIP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms