Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LDLRAP1Q5SW96 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDLRAP1Q5SW96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAP1Q5SW96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAP1Q5SW96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms