Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM240Q5SV17 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM240Q5SV17 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM240Q5SV17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM240Q5SV17 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM240Q5SV17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM240Q5SV17 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms