Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNFT1Q5M7Z0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT1Q5M7Z0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT1Q5M7Z0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNFT1Q5M7Z0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms