Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SLC27A3Q5K4L6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC27A3Q5K4L6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SLC27A3Q5K4L6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC27A3Q5K4L6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms