Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB41Q5JT25 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB41Q5JT25 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB41Q5JT25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB41Q5JT25 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB41Q5JT25 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms