Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGD3Q5JSP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGD3Q5JSP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD3Q5JSP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms