Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf38Q5JPI3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf38Q5JPI3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C3orf38Q5JPI3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C3orf38Q5JPI3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C3orf38Q5JPI3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms