Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4orf48Q5BLP8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms