Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALFQ53S48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALFQ53S48 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ALFQ53S48 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALFQ53S48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms