Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC92Q53HC0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC92Q53HC0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC92Q53HC0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms