Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf46Q504U0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf46Q504U0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf46Q504U0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf46Q504U0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms