Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF260Q3ZCT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF260Q3ZCT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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