Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM44Q2T9K0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM44Q2T9K0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM44Q2T9K0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM44Q2T9K0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM44Q2T9K0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM44Q2T9K0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms