Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MICAQ29983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MICAQ29983 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MICAQ29983 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MICAQ29983 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MICAQ29983 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MICAQ29983 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAQ29983 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAQ29983 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAQ29983 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAQ29983 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICAQ29983 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICAQ29983 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAQ29983 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAQ29983 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICAQ29983 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAQ29983 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAQ29983 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAQ29983 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICAQ29983 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAQ29983 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAQ29983 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAQ29983 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAQ29983 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICAQ29983 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAQ29983 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAQ29983 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICAQ29983 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAQ29983 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAQ29983 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAQ29983 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICAQ29983 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICAQ29983 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICAQ29983 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICAQ29983 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICAQ29983 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MICAQ29983 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MICAQ29983 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MICAQ29983 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MICAQ29983 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MICAQ29983 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MICAQ29983 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MICAQ29983 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MICAQ29983 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICAQ29983 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICAQ29983 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICAQ29983 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICAQ29983 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICAQ29983 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MICAQ29983 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MICAQ29983 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MICAQ29983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MICAQ29983 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MICAQ29983 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MICAQ29983 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MICAQ29983 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MICAQ29983 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICAQ29983 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAQ29983 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAQ29983 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAQ29983 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAQ29983 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICAQ29983 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAQ29983 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAQ29983 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAQ29983 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAQ29983 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICAQ29983 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAQ29983 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAQ29983 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAQ29983 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MICAQ29983 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAQ29983 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAQ29983 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAQ29983 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICAQ29983 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAQ29983 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MICAQ29983 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MICAQ29983 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MICAQ29983 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MICAQ29983 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MICAQ29983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms