Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKN1Q16512 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKN1Q16512 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKN1Q16512 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKN1Q16512 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKN1Q16512 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
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