Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB35Q15286 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB35Q15286 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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RAB35Q15286 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB35Q15286 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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