Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
CHD4Q14839 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHD4Q14839 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHD4Q14839 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHD4Q14839 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
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CHD4Q14839 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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CHD4Q14839 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHD4Q14839 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CHD4Q14839 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHD4Q14839 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
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