Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF3Q14653 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF3Q14653 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF3Q14653 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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