Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CNGB1Q14028 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CNGB1Q14028 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CNGB1Q14028 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CNGB1Q14028 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CNGB1Q14028 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CNGB1Q14028 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNGB1Q14028 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
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