Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCINQ13939 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCINQ13939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCINQ13939 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCINQ13939 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCINQ13939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCINQ13939 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCINQ13939 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCINQ13939 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCINQ13939 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCINQ13939 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCINQ13939 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCINQ13939 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCINQ13939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCINQ13939 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCINQ13939 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCINQ13939 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCINQ13939 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCINQ13939 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCINQ13939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCINQ13939 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCINQ13939 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCINQ13939 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCINQ13939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCINQ13939 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCINQ13939 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCINQ13939 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCINQ13939 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCINQ13939 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCINQ13939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCINQ13939 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCINQ13939 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCINQ13939 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCINQ13939 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCINQ13939 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCINQ13939 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCINQ13939 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCINQ13939 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCINQ13939 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCINQ13939 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCINQ13939 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCINQ13939 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCINQ13939 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCINQ13939 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCINQ13939 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCINQ13939 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCINQ13939 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCINQ13939 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCINQ13939 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCINQ13939 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCINQ13939 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCINQ13939 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCINQ13939 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCINQ13939 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCINQ13939 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCINQ13939 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCINQ13939 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCINQ13939 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCINQ13939 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCINQ13939 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCINQ13939 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCINQ13939 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCINQ13939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCINQ13939 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCINQ13939 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCINQ13939 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCINQ13939 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCINQ13939 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCINQ13939 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCINQ13939 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCINQ13939 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCINQ13939 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCINQ13939 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCINQ13939 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCINQ13939 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCINQ13939 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCINQ13939 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCINQ13939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCINQ13939 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCINQ13939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCINQ13939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
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