Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3CQ13748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA3CQ13748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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