Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSTA3Q13630 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSTA3Q13630 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSTA3Q13630 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSTA3Q13630 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms