Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAE1Q13564 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NAE1Q13564 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NAE1Q13564 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NAE1Q13564 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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