Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
PKD2Q13563 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PKD2Q13563 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PKD2Q13563 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PKD2Q13563 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PKD2Q13563 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PKD2Q13563 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
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