Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA4Q13439 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA4Q13439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA4Q13439 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA4Q13439 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA4Q13439 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA4Q13439 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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