Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PDE3BQ13370 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PDE3BQ13370 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDE3BQ13370 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDE3BQ13370 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDE3BQ13370 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PDE3BQ13370 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PDE3BQ13370 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
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