Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PAPPAQ13219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PAPPAQ13219 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PAPPAQ13219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PAPPAQ13219 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PAPPAQ13219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PAPPAQ13219 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PAPPAQ13219 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PAPPAQ13219 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PAPPAQ13219 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PAPPAQ13219 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PAPPAQ13219 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PAPPAQ13219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PAPPAQ13219 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PAPPAQ13219 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PAPPAQ13219 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PAPPAQ13219 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PAPPAQ13219 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
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