Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX3Q13185 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBX3Q13185 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBX3Q13185 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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