Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms