Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IFT88Q13099 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT88Q13099 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT88Q13099 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT88Q13099 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IFT88Q13099 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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